domingo, septiembre 29, 2024

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El CPTAC del NCI publica un nuevo conjunto de datos proteogenómicos


Una imagen conceptual de un investigador pipeteando un poco de líquido en un tubo de ensayo.  Las estructuras químicas flotan alrededor de la imagen.

El conjunto completo de datos proteogenómicos podría permitir muchos nuevos descubrimientos en la investigación del cáncer.

Crédito: iStock

Qué

Los Institutos Nacionales de Salud están publicando un conjunto de datos completo que estandariza datos genómicos, proteómicos, de imágenes y clínicos de estudios individuales de más de 1000 tumores en 10 tipos de cáncer. Investigadores de todo el mundo podrán utilizar este recurso disponible públicamente para descubrir nuevos conocimientos moleculares sobre cómo se desarrollan y progresan los cánceres. El conjunto de datos fue generado por el Consorcio de Análisis Clínico Proteómico de Tumores (CPTAC) del Instituto Nacional del Cáncer, parte de los Institutos Nacionales de Salud.

El conjunto de datos proteogenómicos pan-cáncer, que se describe en un artículo publicado en Célula cancerosa, se basa en décadas de avances tecnológicos en la ciencia proteómica. El lanzamiento de este conjunto de datos respalda el objetivo Most cancers Moonshot℠ de la Administración Biden-Harris de acelerar la investigación del cáncer mediante un mejor intercambio de datos. Dos artículos de investigación adicionales publicados en Celúla realizado por investigadores del CPTAC proporciona una demostración inicial del potencial del conjunto de datos como recurso valioso para el descubrimiento científico. En el primer artículo, se utilizan análisis multiómicos para vincular las mutaciones impulsoras del cáncer con patrones de proteínas. El segundo artículo profundiza en modificaciones de proteínas que regulan la señalización y la fisiología celular para mostrar asociaciones con la reparación del ADN, el metabolismo y la inmunidad en diferentes tipos de tumores.

El conjunto de datos proteogenómicos pan-cáncer estará disponible públicamente a través de los repositorios Commons de datos de investigación del cáncer del NCI. Se puede acceder a los datos de proteómica a través de Proteomic Information Commons en https://pdc.most cancers.gov/pdc/cptac-pancancer. Se puede acceder a los datos genómicos y transcriptómicos a través de Genomic Information Commons en https://portal.gdc.most cancers.gov y el Servicio de Datos sobre el Cáncer en https://dataservice.datacommons.most cancers.gov/.

OMS

Henry Rodríguez, Ph.D., MBA y Ana I. Robles, Ph.D., División de Tratamiento y Diagnóstico del Cáncer, Instituto Nacional del Cáncer

Los estudios

Datos y recursos proteogenómicos para el análisis pan-cáncer” aparece el 14 de agosto en Célula cancerosa. La proteogenómica pan-cáncer conecta los impulsores oncogénicos con los estados funcionales» y «El análisis pan-cáncer de modificaciones postraduccionales revela patrones compartidos de regulación de proteínas”aparece el 14 de agosto en Celúla.

Acerca del Instituto Nacional del Cáncer (NCI): El NCI lidera el Programa Nacional del Cáncer y los esfuerzos de los NIH para reducir drásticamente la prevalencia del cáncer y mejorar las vidas de los pacientes con cáncer y sus familias, a través de la investigación sobre la prevención y la biología del cáncer, el desarrollo de nuevas intervenciones y la capacitación y tutoría de nuevos investigadores. Para obtener más información sobre el cáncer, visite el sitio internet del NCI en most cancers.gov o llame al centro de contacto del NCI, el Servicio de Información sobre el Cáncer, al 1-800-4-CANCER (1-800-422-6237).

Acerca de los Institutos Nacionales de Salud (NIH): NIH, la agencia de investigación médica del país, incluye 27 institutos y centros y es un componente del Departamento de Salud y Servicios Humanos de EE. UU. Los NIH son la principal agencia federal que realiza y apoya la investigación médica básica, clínica y traslacional, y está investigando las causas, tratamientos y curas de enfermedades comunes y raras. Para obtener más información sobre los NIH y sus programas, visite nih.gov.

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