Características del paciente
Durante el período de estudio, 120 (3,32%) de 3616 PLWH se clasificaron como LLV, 57 (54,81%) como iLLV y 47 (45,19%) como pLLV. Entre ellos, se obtuvieron con éxito 104 (86,67%, 104/120) secuencias de genes pol parciales e INT de longitud completa, de las cuales 57 (54,81%) eran de individuos iLLV y 47 (45,19%) eran de pLLV. Por lo tanto, 104 personas fueron elegibles para el análisis en este estudio, con una edad media de 45,5 años (RIC, 34-57). En whole, los varones representaron el 78,85% (82/104); El 58,65% (61/104) de los individuos estaban casados. La principal vía de transmisión fue la orientación heterosexual, con un 40,38% (42/104), seguida de hombres que tienen sexo con hombres (HSH) (34,62%, 36/104) y plasmaféresis (17,31%, 18/104). En 83 personas con un recuento inicial de células T CD4+ disponible, la mediana del recuento inicial de células T CD4+ fue de 216 células/μl (mín./máx., 3/716). En 80 personas con recuento de células T CD4+ en el LLV disponible, la mediana del recuento inicial de células T CD4+ fue de 374 células/μl (mín./máx., 81/1826). En 48 personas con datos de VL inicial, la mediana de VL inicial fue de 45 744 (mín/máx, 150/2 498 565) copias/ml. La mediana de VL en LLV fue de 96 (mín./máx., 53/983) copias/mL; las características demográficas detalladas de las PLWH se enumeran en la Tabla 1.
Caracterización genética
De las 104 secuencias parciales del gen pol determinadas, el 67,31% (70/104) derivaban del ARN del VIH. El análisis de subtipificación se realizó mediante el envío de secuencias a la herramienta de subtipificación REGA VIH-1 en línea. Según los resultados, predominó el subtipo B (48,08%, 50/104), seguido de CRF07_BC (31,73%, 33/104), CRF01_AE (15,38%, 16/104), CRF55_01B (3,85%, 4/104) y CRF08_BC (0,96%, 1/104). La distribución de subtipos fue comparable entre las muestras de LLV genotipadas mediante el ensayo basado en el ARN del VIH-1 y el ensayo basado en el ADN proviral del VIH-1 (Tabla 2). Cifra 1 muestra el análisis filogenético con cepas de referencia, incluidos todos los subtipos confirmados. Según el árbol filogenético inferido, todos los subtipos determinados se agruparon con cepas de referencia, lo que indica resultados consistentes y subtipos correctos.
El árbol filogenético basado en la secuencia pol parcial se construyó utilizando el software program Molecular Evolutionary Genetic Evaluation (MEGA) (versión XI) basado en el método de unión de vecinos y el modelo Normal Time Reversible con 1000 réplicas de arranque. Los TDRM de diferentes subtipos se muestran en diferentes colores. Secuencias de referencia (GenBank No. U51189, AF286226, AF286229, AF069670, AY945737, DQ207940, U21135, AF067155, JX574661, AF077336, AF061642, AF190127, AF082395, AF286236) se descargaron de la base de datos de secuencias de VIH de Los Alamos (https://www.hiv.lanl.gov/).
Prevalencia y distribución de DRM
Entre los 104 individuos LLV con secuencias de genes pol parciales e INT de longitud completa disponibles, se detectaron DRM de cualquier fármaco en el 42,31 % (44/104). La resistencia a los NNRTI fue dominante (37/104, 35,58%), seguida de los NNRTI (24/104, 23,08%), los IP (6/104, 5,77%) y los INSTI (4/104, 3,85%) (Fig. 2A). V179D/E/L/VD (12, 11,54%), M184V/I (19, 18,27%), M46I y Q58E (3, 2,88%) y E157Q (2, 2,08%) fueron las mutaciones observadas con más frecuencia contra los NNRTI. , NRTI, IP e INSTI (Fig. 2, BD). Un análisis más detallado indicó que 22 (21,15%) individuos tenían resistencia a los medicamentos de clase única, 17 (16,35%) de clase twin y 5 (4,81%) de clase triple (datos no mostrados). Cuando se categorizaron por genotipos, los DRM se observaron más en CRF55_01B (100,0%, 4/4), seguido de B (48,00%, 24/50), CRF07_BC (30,30%, 10/33) y CRF01_AE (37,50%, 6/ 16) (Tabla 2).
Distribución y prevalencia de DRM específicos de clases de drogas en personas que viven con LLV en la ciudad de Zhengzhou, 2023. (A) prevalencia de DRM para cuatro clases de medicamentos (NNRTI, NRTI, PI e INSTI); (B) DRM específicos estratificados por NRTI; (C) DRM específicos estratificados por NNRTI; (D) DRM específicos estratificados por PI e INSTI. Las mutaciones de resistencia mayor y menor están resaltadas en rojo y azul, respectivamente. NNRTI, inhibidores de la transcriptasa inversa no nucleósidos; NRTI, inhibidores nucleósidos de la transcriptasa inversa; PI, inhibidores de proteasa; INSTI, inhibidores de la transferencia de cadena de la integrasa. Whole: muestras de LLV genotipificadas por ARN de VIH-1 o ADN proviral; ARN: muestras de LLV genotipificadas por ARN de VIH-1; ADN: muestras de LLV genotipificadas por ADN proviral del VIH-1. ABC, abacavir; AZT, zidovudina; FTC, emtricitabina; 3TC, lamivudina; TDF, tenofovir; DOR, doravirina; EFV: efavirenz; ETR, etravirina; NVP, nevirapina; RPV, rilpivirina; DRV/r, darunavir/r; LPV/r, lopinavir/r; BIC: bictegravir; CAB, cabotegravir; DTG, dolutegravir; EVG, elvitegravir; RAL, raltegravir.
Además, analizamos cada fármaco de forma independiente. NVP dominó en el nivel alto, DOR y RPV dominaron en el nivel medio, ABC dominó en el nivel bajo y ETR dominó en el nivel potencialmente bajo de fármacos resistentes. Dado que más del 90% de las personas que viven con el VIH elegirían los actuales regímenes de medicamentos gratuitos para su tratamiento, la prevalencia de los DRM frente a los medicamentos ART gratuitos disponibles (ABC, AZT, 3TC y TDF de los NRTI, NVP y EFV de los NNRTI y LPV/r de los IP) en China fueron analizados. Nuestros resultados indicaron que la prevalencia basic de DRM a los siete medicamentos ART gratuitos fue del 36,54% (38/104), mientras que los DRM que condujeron a un nivel bajo o superior de resistencia fue del 25,96% (27/104). Estos incluyeron resistencia de nivel bajo o superior a ABC, AZT, 3TC y TDF de los NRTI en 21,15% (22/104), 7,69% (8/104), 21,15% (22/104) y 15,38% (16). /104), respectivamente; a NVP y EFV de los NNRTI en 24,04% (25/104) y 24,04% (25/104), respectivamente; y al LPV/r de los IP en el 2,88% (3/104). En la figura 1 se muestra información detallada sobre la resistencia a los medicamentos relacionada con los DRM a los regímenes de TAR. 3.
Resistencia prevista a los medicamentos antirretrovirales entre secuencias pol del VIH-1 con DRM en PVVS con LLV en la ciudad de Zhengzhou, 2023. (A) Diferentes niveles de resistencia a los medicamentos de cuatro clases de medicamentos antirretrovirales predichos por la Base de datos de resistencia a los medicamentos contra el VIH de Stanford en muestras de LLV genotipadas por ARN del VIH-1 o ADN proviral; (B) Diferentes niveles de resistencia a los medicamentos de cuatro clases de medicamentos antirretrovirales predichos por la Base de datos de resistencia a los medicamentos contra el VIH de Stanford en muestras de LLV genotipadas por ARN del VIH-1; (C) Diferentes niveles de resistencia a los medicamentos de cuatro clases de medicamentos antirretrovirales predichos por la Base de datos de resistencia a los medicamentos contra el VIH de Stanford en muestras de LLV genotipadas por ADN proviral del VIH-1. ABC, abacavir; AZT, zidovudina; FTC, emtricitabina; 3TC, lamivudina; TDF, tenofovir; DOR, doravirina; EFV: efavirenz; ETR, etravirina; NVP, nevirapina; RPV, rilpivirina; DRV/r, darunavir/r; LPV/r, lopinavir/r; BIC: bictegravir; CAB, cabotegravir; DTG, dolutegravir; EVG, elvitegravir; RAL, raltegravir.
Factores que influyen en los DRM en individuos LLV
Se utilizó un análisis de regresión logística univariante para analizar los factores de influencia asociados con los DRM en PLWH con LLV (Tablas 3 y 4). Según nuestros resultados, los individuos menores de 30 años tenían más probabilidades de desarrollar DRM que otros grupos de edad (OR = 22,286, IC 95% = 2,379–208,789, P <0,05). Las tasas de éxito del genotipado de las PVVS con VL de 50 a 200, 201 a 400, 401 a 999 copias/mL fueron del 85,14 % (63/74), 84,21 % (16/19) y 81,82 % (9/11). respectivamente, y no hubo diferencias estadísticas en la tasa de éxito del genotipado (datos no mostrados). La incidencia de DRM en individuos con LLV con VL entre 401 y 999 copias/ml (OR = 9,375, IC del 95 % = 1,878–46,790, P < 0,05) y 201 y 400 copias/ml (OR = 2,865, IC del 95 % = 1,020 –8,045, P < 0,05) fue significativamente mayor que entre 50 y 200 copias/ml. El análisis de asociación indicó que los individuos con LLV que recibieron un régimen de 2 NRTI + PI/r cuando se detectó LLV (incluidos iLLV y pLLV) tenían más probabilidades de desarrollar DRM (OR = 19,500, IC 95 % = 3,585–106,077, P < 0,05). También se analizaron otros factores como el sexo, el recuento de células T CD4+ durante la LLV, el retraso en el inicio del TAR, la duración del TAR, la ocupación, la categoría de transmisión, la educación y el estado civil, pero no se asociaron significativamente con los DRM.
