martes, septiembre 24, 2024

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La detección de SARS-CoV-2 en aguas residuales de clínicas odontológicas pediátricas refleja el número de casos locales de COVID-19 en niños menores de 10 años


Combinada con datos clínicos y rastreo de contactos, la epidemiología basada en aguas residuales (WBE) permite monitorear la transmisión comunitaria del SARS-CoV-2, dilucidando el inicio, el declive y el resurgimiento de la epidemia.15. En comparación con las aguas residuales comunitarias generales, las aguas residuales dentales pediátricas pueden proporcionar una muestra específica de niños asintomáticos. Este estudio detectó de forma única el ARN del SARS-CoV-2 en las aguas residuales dentales. La detección del ARN del SARS-CoV-2 en 17 muestras coincidió con la aparición de la COVID-19 entre los niños de la prefectura de Saitama. Una muestra obtenida a finales de febrero de 2022 contenía la variante Omicron del SARS-CoV-2. Así, las aguas residuales de las clínicas odontológicas pediátricas pueden proporcionar información sobre la COVID-19 asintomática en niños.

A diferencia de las muestras clínicas de COVID-19, las muestras de aguas residuales contienen ARN viral en concentraciones bajas. Por lo tanto, utilizamos los valores de Ct como referencia sin considerar el número de copias.dieciséis. Para detectar el SARS-CoV-2 utilizamos los cebadores N1 y N2 y el conjunto de sondas desarrollado por los Centros para el Management y la Prevención de Enfermedades (CDC) de EE. UU., que amplifican dos regiones de la nucleocápside (norte) gen17. En el package utilizado en este estudio, CDC N1 y N2 se modifican usando Cy5 y se someten a PCR en el mismo tubo, duplicando así la intensidad de la fluorescencia y mejorando la sensibilidad del ensayo.

En Japón, las características epidemiológicas de la COVID-19 dependientes de la edad variaron entre las oleadas epidémicas18. La sexta ola (variante Omicron) difirió significativamente de las olas anteriores. La proporción de infecciones por SARS-CoV-2 en personas mayores de 70 años fue mayor durante la primera ola (variante B.1.1)19, y el número de casos de personas mayores está disminuyendo gradualmente. El número de casos en personas de 20 a 50 años aumentó notablemente en la segunda a la quinta oleada (variantes B.1.1.284, B.1.1.214, Alfa y Delta, respectivamente)18,19. Durante la sexta ola (variante Omicron)18el número de casos en personas menores de 19 años aumentó rápidamente.

En cuanto a la vacunación en Japón, se utilizaron principalmente las vacunas de ARNm desarrolladas por Pfizer y Moderna.20. La vacunación con la vacuna Pfizer comenzó en abril de 2021, mientras que la vacuna Moderna se introdujo en mayo de 2021. Inicialmente, las vacunas estaban disponibles para las personas mayores y, posteriormente, el rango de edad de vacunación se ha ido ampliando gradualmente hasta los 12 años o más. La vacunación de niños de 5 a 11 años comenzó en febrero de 2022. Es posible que el mayor número de casos se deba a personas de los grupos de edad que no fueron vacunados.

Informes de otros países han indicado una alta prevalencia de las variantes Delta y Omicron (particularmente esta última) entre los niños, lo que implica que las características de cada variante del virus fueron los principales determinantes del número de casos.21,22,23. En este estudio de niños menores de 10 años en la prefectura de Saitama, observamos una cuarta ola indistinta que no entraba en la definición de ola epidémica.18. Durante las oleadas quinta y sexta, la población NWRNC/100.000 aumentó y disminuyó de manera related tanto para los niños en edad preescolar como para los escolares de < 10 años (pag< 0,0001, prueba de pares emparejados de Wilcoxon).

Aunque este estudio no detectó el ARN del SARS-CoV-2 durante el período de dominancia de la variante Alfa, la detección comenzó la misma semana que la de la quinta ola. Mientras tanto, la sexta ola comenzó 5 semanas antes de la detección del ARN del SARS-CoV-2. Creemos que la detección de ARN del SARS-CoV-2 se debió a la visita de pacientes asintomáticos al hospital. Generalmente, la excreción del SARS-CoV-2 comienza 2 días antes de la aparición de los síntomas y persiste durante 7 a ten días. El período de incubación es 1,5 días más largo en los niños que en los ancianos.24mientras que es aproximadamente un día más para la variante Delta (4,41 días; IC 95 %, 3,76–5,05) que para la variante Omicron (3,42 días; IC 95 %, 2,88–3,96)24. El prolongado período de incubación de la variante Delta podría haber aumentado el número de visitas hospitalarias de pacientes asintomáticos. Por el contrario, un número significativamente mayor de niños se vieron afectados por la variante Omicron, incluidos aquellos con infecciones asintomáticas, en comparación con la variante Delta, y se estima que el número de niños asintomáticos fue mucho mayor durante el período predominante de Omicron que durante el período Delta. -período predominante.

En Japón, la vacunación contra la COVID-19 comenzó en abril de 2021. La tasa de cobertura de vacunación (dos dosis) fue de aproximadamente el 20 % durante la quinta ola y alcanzó alrededor del 75 % en diciembre de 2021, con más del 70 % en jóvenes de 12 a 19 años.20. Si bien en ese momento no había ninguna vacuna disponible para niños menores de 12 años, las altas tasas de cobertura de vacunación comunitaria podrían haber contribuido al retraso de cinco semanas en la detección del ARN del SARS-CoV-2 tras el inicio de la sexta ola epidémica (Fig. 2). El marcado aumento de NWRNC durante las primeras cinco semanas de la sexta ola puede haberse asociado con un mayor número de pacientes asintomáticos que visitan la clínica.

Figura 2
Figura 2

Tasa de cobertura de vacunación (la segunda inyección, %)27, período de detección del ARN del SARS-CoV-2 en aguas residuales de una clínica dental pediátrica y número acumulado de casos nuevos notificados semanalmente (NWRNC) por cada 100.000 habitantes menores de 10 años en la prefectura de Saitama, Japón. El período de detección de ARN del SARS-CoV-2 se observó en las semanas 29 a 42 de 2021 (la quinta ola, predominantemente Delta VOC) y las semanas 8 a 21 de 2022 (la sexta ola, predominantemente Omicron VOC).

En este estudio, se detectó ARN del SARS-CoV-2 en aguas residuales hasta 3 semanas después del remaining de la quinta ola, lo que representa un periodo de alto riesgo en cuanto a pacientes asintomáticos que acuden al hospital, ya que las infecciones por COVID-19 en niños suelen ser leves. o asintomático. Además, el ARN viral se puede detectar durante 10 a 14 días después de la resolución de los síntomas. Se ha informado que el número de días necesarios para lograr la negatividad de la PCR es related entre las variantes Delta y Omicron (BA.1).25. El largo COVID-19 fue reconocido por la OMS en 202126 y puede explicar el prolongado período de detección después de la quinta ola.

La variante Omicron se detectó simultáneamente con la detección inicial de ARN del SARS-CoV-2 durante la sexta ola, lo que probablemente representó el pico de liberación de ARN en este período epidémico. A pesar de una rápida disminución de NWRNC después del pico de la sexta ola, se siguió detectando ARN del SARS-CoV-2 hasta el remaining del período de la encuesta.

En los estudios de WBE, la detección de ARN del SARS-CoV-2 generalmente se considera un indicador principal de un aumento en los casos de COVID-19. Sin embargo, en este estudio, las ondas Delta y Omicron (semanas 29 a 39 de 2021 y semanas 3 a 21 de 2022, respectivamente) precedieron a la detección de ARN del SARS-CoV-2 en aguas residuales dentales (semanas 29 a 42 de 2021 y semanas 8 a 2022). 21 de 2022, respectivamente). Es posible que los pacientes asintomáticos hayan visitado la clínica a medida que aumentó el número de casos locales. El aumento del número de casos fue marginal durante la cuarta ola (variante Alfa), y no se detectó ARN del SARS-CoV-2 en las aguas residuales de la clínica de odontología pediátrica. Esto implica que es necesario un número umbral de casos para la detección del ARN del SARS-CoV-2 en aguas residuales dentales. Se utilizó el análisis de las características operativas del receptor (ROC) para estimar el valor límite de NWRNC/100.000 población.

El análisis de riesgo y de corte demostró una fuerte asociación entre la detección de ARN del SARS-CoV-2 en aguas residuales dentales y la población NWRNC/100.000. El RR, IC del 95 % y los resultados de la prueba exacta de Fisher fueron idénticos entre los tres grupos (RR, 5,36 [95% CI, 1.72–16.67]; La prueba exacta de Fisher, pag= 0,0005), aunque los valores de corte difirieron entre los grupos de edad.

Durante el período de detección del ARN del SARS-CoV-2, los pacientes asintomáticos pueden haber recibido tratamiento dental y haber estado en contacto con otras personas en el entorno preescolar, escolar o doméstico. Para todos los grupos de edad, el RR fue mayor en el período de detección de ARN del SARS-CoV-2 en comparación con el de la detección de ARN del SARS-CoV-2. Por lo tanto, los médicos y administradores de salud pública deben ser conscientes de la posibilidad de que haya niños asintomáticos con COVID-19 cuando la NWRNC/100.000 población para niños de < 10 años alcance ≥ 12,8 (preescolares, ≥ 13,4; escolares de < 10 años, ≥ 20,2).

La positividad del ARN del SARS-CoV-2 comenzó cuando el NWRNC entre niños < 10 años alcanzó ≥ 12,8/100.000 habitantes (RR, 7,8 [95% CI, 2.63–23.21]; La prueba exacta de Fisher, pag< 0,0001). Se descubrió que una muestra obtenida en la semana 8 de 2022 albergaba Omicron VOC. Este método también se puede utilizar para detectar otros patógenos virales en aguas residuales dentales.

Este estudio tuvo varias limitaciones. Dado que todos los datos provienen de la prefectura de Saitama, es posible que los hallazgos no se puedan generalizar a otras ubicaciones. Por lo tanto, se necesitan más estudios multicéntricos, utilizando nuestro estudio como guía. Debido a que las muestras de aguas residuales contienen ARN viral en concentraciones bajas, se podría realizar un análisis más completo mejorando la sensibilidad del ensayo. Además, se requieren análisis multivariados para superar los efectos de posibles factores de confusión y sesgos. Con este fin, actualmente se están realizando esfuerzos para recopilar más datos para modelos multivariados, realizar varios estudios multicéntricos y ensayos de mejora de la sensibilidad.

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